关于公司更名的问题

请问下如果ACS认证和签证申请阶段,需要认证相关的工作经验,但是我之前的单位由于在2009年的时候上海浦东新区和南汇区进行了合并,取消了南汇区,因此公司的抬头由“上海市南汇区XXXX“改成了”上海市浦东新区南汇XXX”,然后雇主推荐信的抬头和单位盖章都是最新的单位名称,但是我从税务局开的个人完税证明上的单位名称以及打印的工资单上是以前的单位名称,这种情况应该怎么办呢?另外我是从2004年就开始工作到现在,但是去税务局开个人完税证明,对方说系统是从2006年才建立的,2006年之前的没有完税证明,这样的话我不是少了两年的工作证明吗?在签证阶段会不会有问题?
在这非常感谢飞出国的大力帮助,解决了自己的很多疑惑和问题,专业、无私的态度让人敬佩。谢谢!

公司更名不要紧,也不需要公司配合出证明,材料里(包括推荐信里)说明一下。

个税不全的话也在材料里说明一下,其他证明材料齐全,例如推荐信,社保,工资单能证明实际工作经验的话就不影响工作加分。

如实体现的话对申请结果没有影响。